柳叶刀：一艾滋病患者感染新冠病毒超2年，刷新纪录

咖啡豆

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近日，美国波士顿大学和哈佛大学一项发表于《柳叶刀-微生物》的突破性研究揭示了免疫功能低下者体内新冠病毒的进化密码。研究团队通过对一位晚期HIV感染者长达750天的持续追踪，首次完整记录了新冠病毒在免疫缺陷宿主中的进化轨迹，其突变特征与引发全球疫情的Omicron变种存在惊人的趋同进化现象，为理解新冠病毒变异起源提供了关键证据。

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这项研究聚焦的病例具有典型警示意义：一位CD4+ T细胞计数持续低于35个/μL（正常值500-1200个/μL）的晚期艾滋病患者，在未接受抗逆转录病毒治疗（ART）的情况下，自2020年5月感染新冠病毒后，病毒在其体内持续复制达776天。研究期间采集的8份临床样本显示，病毒基因组形成了独特的B.1谱系单系群，累计出现68个共识水平突变和67个亚共识水平突变，其宿主体内进化速率（6.74×10^-4 突变/位点/年）与同期社区传播病毒（6.11×10^-4）相当，打破了"免疫缺陷宿主加速病毒进化"的传统认知。
值得注意的是，研究揭示了病毒适应性进化的复杂动态：在持续感染过程中，病毒群体出现两个截然不同的亚群交替主导现象。特别是在刺突蛋白基因中，检测到10个与Omicron BA.1/BA.2特征性突变位点重叠的非同义突变，其中9个早在2021年11月Omicron全球爆发前就已存在。这些突变包括增强ACE2受体结合能力的S477N、E484K（对应Omicron的E484A）以及促进上呼吸道复制的N679K等关键位点，其空间分布主要集中在受体结合域（RBD）和NTD结构域表面，与Omicron变异株的突变热点高度吻合。

慢性感染与病毒基因组谱系总结

通过高通量测序技术，研究团队绘制了病毒群体动态变化图谱：在整个感染过程中，病毒群体呈现显著的动态波动，不同突变组合在不同时间点交替占据优势。例如，第522天检测到Asn439Lys突变与Glu484Lys突变呈现负相关性，暗示病毒群体中存在多个适应性亚克隆的共进化现象。这种复杂的群体结构表明，长期感染中病毒并非单向进化，而是在多种选择压力下维持着高度的遗传多样性。
研究最具突破性的发现是病毒适应性代价的证据链：尽管在宿主体内积累了大量免疫逃逸突变，但系统发育分析显示，这些病毒未引发任何已知的传播链。在比对全球超过800万条GISAID序列后，仅发现9个固定突变在全球流行株中出现频率低于3%，提示病毒在适应单一宿主的过程中可能丧失了传播能力。这种"适应性陷阱"现象为解释免疫缺陷宿主作为病毒"进化死胡同"提供了直接证据。
从公共卫生角度看，研究揭示了全球3990万HIV感染者（其中23%未接受治疗）可能构成的潜在病毒库风险。研究发现的NSP6缺失突变（与I型干扰素反应抑制相关）和N端结构域突变模式，不仅出现在所有VOCs中，还在持续感染中展现出独特的进化路径。这种趋同进化提示，免疫缺陷宿主可能是筛选适应性突变的"预演场"，但病毒能否突破适应性瓶颈仍取决于多重因素的复杂平衡。
研究团队通过分子钟分析进一步揭示，病毒在宿主体内的进化并非匀速过程。在感染早期（第312天），病毒已积累包括S477N、E484K在内的关键突变，这些突变在后续阶段持续维持较高频率。而在感染中后期（第630-776天），观察到刺突蛋白furin切割位点区域的突变富集，这种时空动态变化反映了病毒应对宿主微环境改变的适应性策略。

感染期间刺突蛋白基因组中存在的单核苷酸变异（SNVs）总结

该研究还发现了病毒与宿主免疫系统相互作用的新机制：尽管患者CD8+ T细胞应答可能存在，但所有检测到的突变均未出现在N蛋白的CD8+ T细胞表位区域。这暗示病毒可能通过表位逃逸或干扰抗原呈递等机制，与残存的T细胞免疫达成某种"共存平衡"。同时，病毒载量持续高位（鼻拭子检测Ct值始终低于25）与缺乏有效体液免疫形成鲜明对比，揭示了免疫缺陷状态下病毒清除机制的失效。
研究的局限性在于样本量较小和感染时间的不确定性，但这恰好反映了真实临床环境中获取持续感染数据的难度。值得关注的是，研究期间患者始终未接种新冠疫苗，也未接受抗病毒治疗，这种"自然状态"下的进化轨迹为理解病毒生物学特性提供了独特视角。研究团队发现的28270位点固定突变（TAA→T），在GISAID数据库中仅见于另一例慢性感染病例，这种趋同突变可能标志着宿主适应性进化的分子标记。
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这项历时776天的追踪研究为公共卫生政策提供了重要启示：首先，需加强未接受ART治疗HIV感染者的新冠监测，建立早期预警系统；其次，开发针对免疫缺陷宿主的特异性治疗方案，阻断病毒长期进化过程；最后，深入研究NSP6缺失等适应性突变的功能意义，为下一代疫苗设计提供新靶点。正如研究者指出，清除免疫低下者的持续感染应成为全球防疫战略的重要组成部分，这不仅关乎个体健康，更是防控新变异株出现的关键防线。
通过这项研究，我们得以窥见新冠病毒在免疫缺陷宿主体内的进化全貌：这是一个充满动态平衡、适应性博弈的微观生态。病毒在长期宿主中积累的突变既可能成为新变异的源泉，也可能因适应性代价而止步于传播门槛。这种复杂性提醒我们，在推进全球疫苗接种的同时，必须重视免疫弱势群体的健康保障，因为每个持续感染病例都可能是一个潜在的病毒进化实验室。

参考

Velasquez-Reyes, Joseline M., et al. "Characterisation of a persistent SARS-CoV-2 infection lasting more than 750 days in a person living with HIV: a genomic analysis." The Lancet Microbe (2025).

颠颠

又是英国柳叶刀削面机

wakeman

那病毒在他体内持續進化了两年都未死 期間他传染了多少人？

陪着寂寞看孤单

新冠有没有杀死艾滋病毒

hnn

这是那病毒和HIV患者做实验吧，太可怕了

qqwa1234

这样人简直是移动的传染源

疯了吧

现在还是没有制造出来新冠肺炎的有效药物出来呀

wifai

毒王

酷狗e族

啊？这是1➕1远大于2了，千万别促使艾滋病毒变异升级，两种不同病毒以毒攻毒，走向衰减弱化进程是最好的局面

wifai

情花毒和断肠草